Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms