Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
YrdcQ3U5F4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms