Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms