Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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