Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KncnQ307W7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms