Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm1123Q1RME4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms