Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms