Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd9Q14BI7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms