Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
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