Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtel1Q0VGM9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms