Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd12Q0VE29 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms