Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb8Q0VBD0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Itgb8Q0VBD0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms