Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NeblQ0II04 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NeblQ0II04 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NeblQ0II04 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NeblQ0II04 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms