Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms