Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb2Q08331 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms