Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnn1Q08091 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn1Q08091 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn1Q08091 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn1Q08091 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms