Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms