Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdx4Q07424 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms