Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms