Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms