Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcn1Q05186 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms