Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms