Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms