Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms