Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms