Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms