Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms