Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ank1Q02357 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ank1Q02357 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms