Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms