Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms