Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms