Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VegfdP97946 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms