Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx1P82976 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbx1P82976 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbx1P82976 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms