Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms