Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb2P81117 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms