Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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