Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms