Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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