Protein–RNA interactions for Protein: P70324

Tbx3, T-box transcription factor TBX3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx3P70324 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tbx3P70324 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx3P70324 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms