Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms