Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms