Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsnl1P62761 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms