Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copz1P61924 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copz1P61924 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms