Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vbp1P61759 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vbp1P61759 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vbp1P61759 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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