Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms