Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3eP60229 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms