Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp3P59055 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp3P59055 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms