Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms