Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms