Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Kcnn3P58391 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Kcnn3P58391 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Kcnn3P58391 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnn3P58391 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Kcnn3P58391 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnn3P58391 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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